Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms