Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms