Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms