Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF518BQ9C0D4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF518BQ9C0D4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms