Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms