Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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