Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms