Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP4Q9BZE4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms