Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SETD2Q9BYW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SETD2Q9BYW2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms