Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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