Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms