Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYCP2Q9BX26 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms