Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms