Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUSC1Q9BVN2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUSC1Q9BVN2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUSC1Q9BVN2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUSC1Q9BVN2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms