Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
H2AFJQ9BTM1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms