Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms