Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms