Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms