Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDF4Q9BRK5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDF4Q9BRK5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms