Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF559Q9BR84 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms