Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HINFPQ9BQA5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms