Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DUSP9Q99956 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms