Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN18Q99952 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms