Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms