Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYD88Q99836 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms