Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSG101Q99816 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms