Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms