Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L3Q99457 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms