Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP2Q96SN8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms