Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCT8L2Q96SF2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCT8L2Q96SF2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms