Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R9BQ96SB3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R9BQ96SB3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms