Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN1

SLC26A8, Testis anion transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A8Q96RN1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A8Q96RN1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A8Q96RN1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms