Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms