Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms