Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF558Q96NG5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms