Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC43Q96MW1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms