Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms