Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms