Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms