Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEURL4Q96JN8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEURL4Q96JN8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms