Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMX3Q96JJ7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms