Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG1Q96JA1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms