Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC12Q96J65 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC12Q96J65 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms