Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms