Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms