Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms