Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms