Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN4Q96CB9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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