Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms