Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UTP4Q969X6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms